Kwas nukleinowy jest zamknięty w pewnego rodzaju pojemniku lub powłoce, zwanym kapsydem i składa się z powtarzających się podjednostek białkowych, zwanych kapsomery, z kolei utworzone przez powtórzenie jednego, dwóch lub więcej białek. Na przykład w wirusie brodawczaka kapsyd składa się z kilku kopii dwóch różnych białek, L1 i L2; pierwsza, bardziej obfita, ma zdolność do samoagregacji i tworzenia wirionów wolnych od kwasów nukleinowych (jest bardzo immunogenna i dlatego jest wykorzystywana jako podstawa do produkcji szczepionek).
ten rdzeń gwarantuje wirusowi zdolność do przeprowadzania procesów namnażania i wzrostu, a kapsyd nadaje kształt i stabilność cząsteczce wirusa, chroni jej genom i ma znaczenie dla zakaźności (dzięki obecności struktur antyreceptorowych).
Razem kapsyd i kwas nukleinowy tworzą nukleokapsyd.
W naturze istnieją wirusy tworzone tylko przez kwasy nukleinowe i kapsyd, i z tego powodu nazywane są „nagie wirusy"; bakteriofagi są przykładem nagich wirusów. Istnieją również inne cząstki wirusowe, które oprócz kapsydu zawierają najbardziej zewnętrzną błonę, zwaną perykapsydem, peplos lub płaszcz (koperta), który pochodzi z błony komórkowej komórki gospodarza i jako taki składa się głównie z fosfolipidów, ale także z polisacharydów i białek (ogólnie glikoprotein). Wirusy z perykapsydem nazywane są „pokryty wirusem„i ogólnie posiadają również strukturę białkową, zwaną macierzą lub powłoką, umieszczoną między kapsydem a perykapsydem.
Wirusy opłaszczone - dzięki fosfolipidom perykapsydu - łatwiej wnikają do podatnych komórek i zmniejszają odpowiedź immunologiczną gospodarza; adenowirus, odpowiedzialny za objawy zapalenia spojówek i paragrypy, jest przykładem wirusa opłaszczonego, podobnie jak wszystkie inne wirusy, które infekują eukarionty.
Kapsyd wirusowy może normalnie przybierać dwie różne konformacje, charakteryzując się jedną struktura typu icosahedral lub śrubowaty.
Dwudziestościan jest bryłą, utworzoną z trójkątów równobocznych, która ma 12 wierzchołków, 20 ścian złożonych z trójkątów równobocznych i 30 krawędzi odpowiadających bokom trójkątów, podczas gdy wierzchołki są miejscami styku boków.Ta struktura krystalograficzna wywodzi się z związek reguluje więcej białka; każdy z nich nazywany jest monomerem i monomery te mogą łączyć się od pięciu do pięciu tworzących pentony, lub - w większych wirusach - od 6 do 6 tworząc tzw. egzony. Połączenie pentonów i egzonów tworzy eikosaedron, wewnątrz którego znajduje się materiał genetyczny.
W drugiej strukturalnej typologii kapsydu, zwanej helikalną, pojedyncze monomery są ułożone spiralnie wokół osi (białka są ułożone jak stopnie spiralnych schodów), tworząc pusty cylinder, który otacza kwas nukleinowy.
Wirus mozaiki tytoniu jest typowym przykładem wirusa o strukturze spiralnej, podczas gdy wirus brodawczaka ma strukturę dwudziestościenną. Istnieją również wirusy, w których kapsydowi brakuje symetrii i ma mieszaną morfologię (takie jak wirus HIV, który składa się z kapsydu dwudziestościennego i nitkowatego rdzenia kwasu nukleinowego).
Klasyfikacja wirusów
Każdy wirus jest identyfikowany według gatunku, rodzaju i rodziny. Na przykład, jeśli weźmiemy wirusa HIV, to gatunek wskazuje zwyczajową nazwę mikrogranizmu, czyli wirus nabytego niedoboru odporności, a dokładnie HIV.Wirus ten należy do rodzaju lentivirus (tzn. o powolnym cyklu wzrostu) i do retrowirusów (retrowirusy to wirusy o cyklu replikacyjnym charakteryzującym się dwiema formami kwasu nukleinowego, które prezentują enzym zwany odwrotną transkryptazą, zdolny do przeprowadzenia odwrotnej transkrypcji przekształcającej wirusowy RNA w DNA).
Każdy gatunek wirusa jest następnie opisywany na podstawie struktury (wielkość, morfologia i rodzaj kwasu nukleinowego), rodzaju replikacji (jądrowa lub cytoplazmatyczna), komórki gospodarza (zwierzęta, grzyby, rośliny lub bakterie), tropizmu tkanki lub narząd i rodzaj transmisji (kałowo-oralny, pozajelitowy itp.).
Szczepionki przeciwwirusowe
Szczepionki przeciwwirusowe mogą składać się z zabitych (inaktywowanych), atenuowanych wirusów (zachowały one zdolność do replikacji, ale straciły wiele ze swojego potencjału patogenicznego) lub podjednostek wirusowych (szczepionki nowej generacji powstają na przykład z wirusowych białek perykapsydu, zdolny do stymulacji odporności biernej).Preparatem nowej generacji jest szczepionka przeciw wirusowemu zapaleniu wątroby typu B, oparta wyłącznie na glikoproeinie kapsydowej wirusa HBV.
Inne artykuły na temat „Struktury i klasyfikacji wirusów”
- Wirus
- Mnożenie wirusów
- Choroby wywoływane przez wirusy i leki przeciwwirusowe