Zapach kału związany jest głównie z procesami gnilnymi, które wpływają na aminokwasy uciekłe z wchłaniania jelitowego. Te składniki odżywcze są w rzeczywistości przechwytywane przez bakterie okrężnicy, przechodzące proces dekarboksylacji, w wyniku którego powstają następujące toksyczne aminy:
arginina → agmatyna
cystyna i cysteina → merkaptan
histydyna → histamina
lizyna → kadaweryna
ornityna → putrescyna
tyrozyna → tiratina
tryptofan → indol i skatol
Wiele z tych substancji nadaje stolcu szczególnie nieprzyjemny zapach. Stolce stają się dość cuchnące, nawet gdy pozostają w jelicie przez dłuższy czas, a także we wspomnianych przypadkach złego wchłaniania (choroba trzewna, niewydolność trzustki, infekcje jelitowe, choroba Leśniowskiego-Crohna, wrzodziejące zapalenie jelita grubego, zespół krótkiego jelita, mukowiscydoza, wątroba choroby dróg żółciowych i żołądka z towarzyszącą hipochlorhydrią). Kiedy złe wchłanianie dotyczy głównie białka, zapach kału przyprawia o mdłości, natomiast staje się gryzący i przenikliwy, gdy do okrężnicy dostają się duże ilości niewchłoniętych lub źle strawionych cukrów i skrobi, które następnie są sfermentowane przez lokalną florę z wytworzeniem lotnych kwasów tłuszczowych .
Biegunka wegetariańska i kał mają słaby zapach.
Kał o zapachu ryb lub nasienia jest charakterystyczny dla czerwonki bakteryjnej, cholery i ogólniej śluzówki.
Podsumowując, na zapach kału mają więc wpływ nawyki żywieniowe (ilość białka, produkty aromatyczne, takie jak czosnek lub cebula itp.), flora bakteryjna jelit, stan zdrowia i określone nawyki (takie jak palenie czy żucie tytoń) Ogólnie rzecz biorąc, spożywanie małych i dobrze zbilansowanych posiłków, bez łączenia dużych ilości „niezgodnych” pokarmów (patrz dieta zdysocjowana), pomaga zoptymalizować procesy trawienne, zmniejszając częstość występowania zaburzeń, takich jak wzdęcia i wzdęcia, oraz dając stolec o zapachu sui generis.
Każdy przypadek, w którym nieprzyjemnemu zapachowi stolca towarzyszą objawy takie jak czarne, smoliste lub blade stolce, obecność krwi w stolcu, gorączka, dreszcze, silne skurcze brzucha, obfita obecność śluzu w stolcu i utrata masy ciała.
